Ein Basenpaar in der DNA, beispielsweise AT, hat eine tautomerisierte Form A * -T * (resultierend aus dem Umschalten der Seiten beider Protonen entlang der Wasserstoffbrücken).
Ich habe untersucht, wie Mit Hilfe von DFT-Berechnungen kann man die Energiedifferenz zwischen der normalen und der anomalen Form berechnen. Ein weiterer interessanter Punkt ist jedoch die Stabilität des Tautomers.
Ich habe mehrmals gelesen, dass diese anomalen Tautomere sehr schnell zur normalen AT-Form "zerfallen" (viel schneller als die Zeit, in der eine DNA-Replikationsrunde dauert), was interessant ist, weil dies impliziert, dass es sich um eine Tautomerisierung handelt wahrscheinlich keine Quelle für spontane Mutationen.
Was ich lernen möchte, ist wie kann man diese erwartete Lebensdauer des anomalen Tautomers berechnen
Ich habe eine Idee (von der ich nicht weiß, ob sie streng sein könnte oder ob sie vielleicht völlig wertlos ist), bei der eine Born-Oppenheimer-Trennung für die beiden Protonen vorgenommen wird (nach der DFT-Berechnung des elektronischen Bodens) Zustand) und untersuchen dann die nicht-adiabatischen Übergänge zwischen den verschiedenen vibronischen Zuständen des Protonenpaares. Ich gebe gerne Details an, wenn jemand dies wünscht.
Aber vielleicht ist "meine Methode" zu chaotisch oder naiv (oder beides) und / oder es gibt andere Standardansätze, um ungefähr das erwartete mittlere Leben zu berechnen von anomalen Tautomeren wie dem erwähnten A * -T *.
Ich wäre sehr dankbar, wenn jemand einen Einblick und / oder Hinweise darauf geben könnte, wie diese erwarteten Lebensdauern typischerweise in der Computerchemie berechnet werden!